A legfontosabb különbség a citokróm és a fitokróm között az, hogy a citokróm egy elektrontranszfer-hem fehérje, amely részt vesz az aerob légzésben. Eközben a fitokróm egy fotoreceptor fehérje, amely érzékeny a látható spektrum vörös és távolvörös fényére.
Az élő szervezetek különböző típusú pigmentekkel rendelkeznek. Egyesek fényelnyelő pigmentek, míg mások légzőszervi pigmentek. A citokróm egy metalloprotein, amely elektronhordozóként működik az aerob légzésben. Eközben a fitokróm egy fotoreceptor, amely elnyeli a vörös és a távvörös fényt a látható spektrumból. A citokrómhoz képest a fitokrómok a növény fejlődésének számos aspektusában fontosak.