A legfontosabb különbség a centromér és a kromomer között az, hogy a centromér egy szűkített régió, amely a testvérkromatidákat egyesíti egy kromoszómában, míg a kromomer egy lineárisan elrendezett gyöngyszerű szerkezet, amely a kromoszóma hosszában van jelen.
A kromoszóma egy szálszerű szerkezet, amely nukleinsavakból és fehérjékből áll. Egy szervezet genetikai információit tartalmazzák. A kromoszómában számos különálló régió található, köztük kromatidok, centromér, kromomer és telomer. A centromér a látható összehúzódási pont a kromoszómában. Összekapcsolja a testvérkromatidákat, és fontos a sejtosztódás során. Ezzel szemben a kromomerek szorosan tekercselt kromatinok vannak jelen a kromoszóma hosszában. Gyöngyként jelennek meg egy húron. Az öröklés során géneket hordoznak.
