A legfontosabb különbség a kemoorganotrófok és a kemolitotrófok között az, hogy a kemoorganotrófok olyan organizmusok, amelyek szerves vegyületekből nyernek elektronokat, míg a kemolitotrófok olyan szervek, amelyek szervetlen vegyületekből nyernek elektronokat.
Az élőlények az energiaforrás és a szén alapján a táplálkozási móddal kapcsolatban több kategóriába sorolhatók. Vannak energiaforrások, mint napfény és szerves vegyületek. Hasonlóképpen kétféle szénforrás létezik, mint szervetlen szén és szerves szén. A négy fő kategória a fotoautotrófok, a fotoheterotrófok, a kemoautotrófok és a kemoheterotrófok. Ezenkívül az egyenérték redukálásának elsődleges forrása alapján két kategória van, mint organotróf és litotróf. A kemoorganotrófok és a kemolitotrófok két csoport, amelyek a kémiai vegyületek megtöréséből származó energiát használják fel. De különböznek egymástól az elektrondonor alapján. Az elektrondonor forrása a kemoorganotrófokban található szerves vegyületek, míg a redukciós ekvivalens forrása szervetlen a kemolitotrófokban.
