A legfontosabb különbség a petefészek-ciklus és a menstruációs ciklus között az, hogy a petefészek-ciklus az a ciklus, amely a petefészkekben történik, míg a menstruációs ciklus a méhfalához kapcsolódó méhben.
A petefészek-ciklus és a menstruációs ciklus két ciklus fordul elő nőknél. Ez a két ciklus felkészíti a nőt arra, hogy megfoganjon, utódot szüljön és anyává váljon. Mindkét ciklus a női reproduktív rendszerben fordul elő. Tehát hormon-reagálási ciklusok. A nőstények a pubertástól a menopauzáig tartják ezt a két ciklust. Az eseménysorozat e két ciklus alatt zajlik, és főként a hormonok vezérlik őket. Amikor a terhesség bekövetkezik, mindkét ciklus leáll, és ezt az emberi koriongonadotropin (hCG) nevű hormon végzi.
