A legfontosabb különbség a gombák és a paraziták között az, hogy a gombák az eukarióta saprotrofi szervezetek csoportja, beleértve az élesztőket, a penészeket és a gombákat, míg a paraziták egy másik organizmuson vagy azon belül élő szervezetek, amelyek tápanyagot kapnak.
A gombák és a paraziták egyaránt különböző betegségeket okoznak az emberekben. Nem csak az embereknél, de a paraziták más állatokban és növényekben is betegségeket okoznak. A paraziták azok a szervezetek, amelyek parazitizmusnak nevezett életmódot mutatnak. A parazitizmus a szimbiotikus kapcsolatok három típusának egyike, amely két vagy több együtt élő faj között létezik. Bizonyos gombafajok, egyes rovarok, protozoonok és helminták példák a parazitákra. A parazitizmusban a paraziták egy másik, gazda nevű organizmuson vagy annak belsejében élnek; a parazitizmus csak a parazitáknak nyújt előnyöket, miközben betegségeket okoz gazdájának. Sőt, a paraziták nem élhetnek túl gazdáik nélkül.