A legfontosabb különbség az intracelluláris és az intercelluláris jelzés között az, hogy az intracelluláris jelzés a sejten belüli kommunikáció, míg a sejtek közötti jelzés a sejtek közötti kommunikáció.
A sejtek jelzőmolekulákat bocsátanak ki a célsejtek számára, és jelzőmolekulákon keresztül kommunikálnak egymással többsejtű organizmusokban. A célsejtek receptorai vannak a sejtfelszínükön és a citoplazmában, hogy a jeleket fogadják és ennek megfelelően cselekedjenek. A sejten belül kommunikáció lép fel az organellumok és a sejt között a sejtfunkciók végrehajtása érdekében. Ezért két típusú sejtkommunikáció létezik: intracelluláris jelzés vagy kommunikáció és sejtközi kommunikáció vagy jelzés.