A zuzmó és a mikorrhiza között a legfontosabb különbség az, hogy a zuzmó kölcsönös asszociáció, amely az algák / cianobaktériumok és a gombák között létezik, míg a mikorrhiza a magasabb rendű növény gyökerei és egy gomba közötti kölcsönös asszociáció típusa.
A kölcsönösség a szimbiózis három típusának egyike, amely két különböző organizmusfaj között fordul elő. A másik két típustól eltérően a kölcsönösség mindkét társulás számára előnyös. A zuzmó és a mycorrhiza a kétféle példa a kölcsönös asszociációkra. Mindkettő ökológiailag fontos kapcsolat. A zuzmó két fele az alga vagy a cianobaktérium és a gomba. Másrészt a mikorrhizák két fele egy magasabb növény gyökere és egy gomba.