A legfontosabb különbség a parazita gyökerek és a mikorrhizák között az, hogy a parazita gyökerek a nem fotoszintetikus parazita növények gyökerei, míg a mikorrhizák a fotoszintetikus magasabb növény gyökerei és egy gomba között létrejövő kölcsönös asszociációs típusok.
A parazitizmus és a kölcsönösség két szimbiotikus asszociáció, amelyek két különböző, együtt élő faj között léteznek. A parazitizmus csak a paraziták számára előnyös, mivel a parazita táplálékokat és egyéb követelményeket szerez a gazdától, miközben károsítja azt. Másrészről a kölcsönösség mindkét partner számára előnyös, akik az egyesületben vannak. A mycorrhizák egyfajta kölcsönös asszociáció, amely egy magasabb rendű növény és egy gomba között fordul elő. A gomba a magasabb növények gyökereiben él. A magasabb rendű növények táplálékkal látják el a gombát, míg a gomba a talajtól a növényig felszívja a vizet és a tápanyagokat.
