A taxonómia és a szisztematika közötti legfontosabb különbség az, hogy a taxonómia az organizmusoknak a taxonokba történő osztályozásának fegyelme azáltal, hogy rendezetten rendezi őket, míg a szisztematika a biológia tág területe, amely a fajok diverzifikációját kutatja.
A taxonómia és a szisztematika nagyon szorosan kapcsolódnak egymáshoz a biológiában. Mégis érdekes különbségek vannak a taxonómia és a szisztematika között. E kettő nagyon hasonlósága miatt sokan azt várnánk, hogy ezek hasonló jelentéssel bírnak. Ezért szorosan tanulmányozni kell ezt a két tudományterületet a taxonómia és a szisztematika közötti tényleges különbség megértése érdekében, mert sokan, köztük az alapvető biológusok, talán némi zavarban vagyunk.
