A legfontosabb különbség az endothelium és a mesothelium között az, hogy az endothelium az egyszerű laphámsejt-réteg, amely az egész keringési rendszert körülveszi, beleértve az ereket, a nyirokereket és a szívet, míg a mesothelium az egyszerű pikkelyes hámsejtréteg, amely a test fő üregeit sorolja fel, mint pl. a hashártya, a mellhártya és a szívburok.
Az epithelium, a mesothelium és az endothelium háromféle sejtréteg, amelyek belső szerveinket, testüregünket és bőrünket szegélyezik. Ezért ezek mind a test védőgátjai. Szerkezetileg a mesothelium és az endothelium speciális vagy módosított epiteliális rétegek, mezodermális eredetűek. Ennek megfelelően egyszerű laphámsejtekből állnak. A mesothelium és az endothelium is egyrétegű szövet. Bizonyos belső felületeket bélelnek.