A nephridia és a malpighius tubulus közötti legfontosabb különbség az organizmusokban való előfordulásuktól függ. A nephridia alacsonyabb organizmusokban, például férgekben és puhatestűekben van jelen, míg a malpighius tubulusok a rovarok és a szárazföldi ízeltlábúak hátsó régióiban vannak.
A kiválasztás az élő szervezetek fontos szempontja. Az anyagcsere utak különféle kiválasztó termékeket hoznak létre melléktermékként. A hulladék felhalmozódása az élő testrendszerben azonban mérgező és káros. Ezért elengedhetetlen egy olyan mechanizmus jelenléte, amely eltávolítja az anyagcsere-hulladékot a szervezetből a kiválasztási rendszer révén. Ezért különböző típusú kiválasztó szervek vannak jelen a különböző organizmuscsoportokban. A nephridia és a malpighius tubulusok két példája az ilyen kiválasztó szerveknek.