A bioreaktor és a fermentor közötti fő különbség a zárt edények belsejében lejátszódó biokémiai reakció típusa. A bioreaktor megkönnyíti a biokémiai reakciók minden típusát, a fermentor azonban csak a fermentációt.
A biotechnológia alkalmazása az iparban érdekes tudományterület. Ezek az alkalmazások a mikrobiális alkalmazásoktól az állati alapú alkalmazásokig változnak. Ezenkívül a biotechnológia ipari felhasználása fő területeken, például a mezőgazdaságban, az orvostudományban és a különböző iparágakban eltérő. A bioreaktorok zárt edények, amelyekben megteremtik a szükséges feltételeket a különféle típusú biokémiai reakciók megkönnyítésére. A fermentorok a bioreaktorok csoportjába tartoznak, de különösen csak fermentáció elvégzésére szolgál.