A legfontosabb különbség a földrajzi és a szaporodási izoláció között az, hogy a földrajzi elszigeteltség a reproduktív izoláció olyan kategóriája, amely az élőlények populációinak szétválasztására utal a genetikai anyag párzásától vagy fizikai határok közötti cseréjétől, míg a reproduktív izoláció a fajok megelőzését szolgáló mechanizmusok együttesére párzástól és termékeny utódok előállításától.
A megtermékenyítés a spermium és a petesejt egyesülése, amely a nemi szaporodás során diploid zigótát képez. Ha a termelt zigóta érett, végül egészséges termékeny utód lesz belőle. ezért a reproduktív izoláció olyan folyamat, amely megakadályozza a termékeny utódok kialakulását. Ez a megelőzés a megtermékenyítési folyamat során vagy a megtermékenyítés után következhet be. Végül is gátat szab a termékeny utódok előállításának, amelyek újabb termékeny utódokat szülhetnek. A különböző mechanizmusok közül a földrajzi elszigeteltség a reproduktív izoláció tényezője.
