A fő különbség a primer és a szekunder allil-karbokációk között az, hogy az elsődleges allil-karbokáció kevésbé stabil, mint a szekunder allil-karbokáció.
Az allil-karbokáció egy rezonanciával stabilizált szénszerkezet. Ez egy pozitív töltést tartalmazó ion. Ezekben az ionokban a pozitív ion az allil szénatomra kerül (az allil szénatom a kettős kötés szomszédos atomja). A primer allil-karbokáció olyan allil-karbokáció, ahol a pozitív töltés egy primer szénatomra kerül, míg a szekunder allil-karbokáció olyan allil-karbokációra, ahol a pozitív töltés egy másodlagos szénatomra kerül.