A legfontosabb különbség a mikoplazma és a klamidia között az, hogy a mikoplazma egy olyan baktérium nem, amelyből hiányzik a sejtfal, míg a klamidia egy olyan baktérium nem, amely gram-negatív és kötelező parazitákat tartalmaz.
A Mycoplasma fajok a legkisebb baktériumok, amelyeket eddig felfedeztek, a legkisebb genomokkal és minimális számú, nagyon fontos organellummal. A Mycoplasma fal nélküli baktérium. Ennélfogva nincs határozott alakjuk. Általában gömb alakúak a rostos alakú sejtek számára. Ezzel szemben a chlamydia baktérium nemzetség, amelynek sejtfala van. Gram-negatív baktériumok. A mycoplasma és a chlamydia is nemi úton terjedő betegségeket okoz. Sőt, hasonló tüneteket produkálnak, de különböző antibiotikumokkal kezelhetők.
