A kiméra és a mozaik közötti legfontosabb különbség az egyes szervezetek kialakulásában részt vevő zigóták száma. A különböző sejtpopulációk a kimérában található két zigótából, míg a különböző sejtpopulációk a mozaik egyetlen zigótájából származnak.
A kiméra és a mozaik kezdetben mitikus fogalmak voltak a genetikai kombinációról. A genetika és a molekuláris biológia fejlődésével azonban mára tudományos szempontból meg lehetett magyarázni a kiméra és a mozaik jelenségeit. Mind a kimérizmusban, mind a mozaikban a testsejtek egy része más genomot hordoz. Így ugyanaz a szövet két vagy több különböző sejtpopulációt tartalmazhat. Ezenkívül két zigóta vesz részt egy kimérává fejlődő embrió kialakulásában, míg egyetlen zigóta a mozaikokká fejlődő embrió kialakulásában. A korai fejlődés mutációja a mozaikosság oka, míg két különböző zigóta bevonása a kiméra oka.
