A legfontosabb különbség az auxin és a citokinin között az, hogy az auxin serkenti a gyökérelágazást, míg a citokinin gátolja a gyökérelágazást és az oldalirányú gyökérképződést. Ehhez még hozzá kell adni, hogy az auxin elsősorban a sejtek megnyúlásáért felelős a szárban és a gyökércsúcsokban, míg a citokininek elsősorban a sejtosztódásért felelősek, és ezért a növekvő területeken találhatók meg.
A növényi hormonokként is ismert fitohormonok fontos kémiai anyagok a növények növekedésében és fejlődésében. Szerves molekulák, és jelzőmolekulaként működnek, amelyek szabályozzák a növény fejlődését. A növényi hormonoknak öt fő típusa van: auxin, gibberellin, citokinin, etilén és abszcizinsav. Így egyedül és együtt különböző funkciókat látnak el, hogy befolyásolják a növények növekedését.
