A legfontosabb különbség a pluripotens és az indukált pluripotens őssejtek között az, hogy a pluripotens sejtek differenciálatlan anyasejtek (embrióktól stb. Származnak), amelyek természetes módon képesek differenciálódni különböző sejttípusokká, míg az indukált pluripotens őssejtek olyan szomatikus felnőtt sejtek, amelyek genetikailag átprogramozták, hogy a természetes pluripotens őssejtekhez hasonló tulajdonságokat mutassanak.
Az őssejt egy differenciálatlan sejt, amely egyedülállóan képes különböző vagy speciális sejtekké fejlődni. Ezenkívül az őssejtek három típusból állnak, nevezetesen unipotens, pluripotens és multipotens. Ha egy őssejt megkülönböztethető egy, többszörösé és minden sejttípusra, akkor unipotens, multipotens vagy pluripotens őssejtként ismerjük. A fenti három típus közül a pluripotens őssejtek fontosak, mivel minden sejttípusra megkülönböztethetők. Egy pluripotens embrionális őssejt egész emberré fejlődhet.
