shRNS vs siRNS
Az RNS-interferencia (RNSi) folyamata során a célgén expresszióját nagy specifitással és szelektivitással kopogtatják le. Az RNSi természetes folyamat, és kis interferáló RNS-t (siRNS), rövid hajtű-RNS-t (shRNS) és kétfunkciós shRNS-t tartalmaz. Jelenleg az RNAi-t széles körben használják a személyre szabott rákterápia eszközeként. Az RNSi alkalmazása alapvetően a kémiailag szintetizált kétszálas siRNS és vektor alapú shRNS molekulákkal történik. Bár ennek a két molekulának hasonló funkcionális eredménye van, szerkezetében különböznek egymástól; így ennek a két molekulának a molekuláris hatásmechanizmusai, az RNS útvonalai és a célon kívüli hatásai is különböznek.
shRNS
Az shRNS egy kis RNS-molekula szekvenciája, amely szoros hajtű-fordulatot tesz, amely felhasználható a célgén expressziójának elnémítására az RNSi alatt. Az shRNS expresszióját egy vektorral lehet elérni, amely lehet vírus vagy baktérium, vagy plazmidok bejuttatásával. A sejtmagban szintetizálódnak, és további folyamatok céljából a citoplazmába szállítják őket. Ezeknek a molekuláknak a miRNS érési útja hasonló; így a miRNS szintézise megalapozta az shRNS szintézis megértését. Bármelyik RNS-polimeráz II vagy III átírhatja az shRNS-t RNS-polimeráz II vagy III promótereken keresztül. Az shRNS-ek használatának előnye, hogy viszonylag alacsony lebomlási és forgalmi sebességgel rendelkeznek. Hátránya, hogy szüksége van egy expressziós vektorra, amely biztonsági problémákat okozhat.
siRNS
Az siRNS-ek kétszálú RNS-molekulák, amelyek 20-25 bázispár hosszúságúak. Ezeket gének szuppressziójára használjuk úgy, hogy bármely gént elhallgattatunk komplementer nukleotidszekvenciával az RNSi útvonalon. Az siRNS transzfekciójával történő gén leütés az átmeneti hatás miatt gyakran sikertelen; különösen a gyorsan osztódó sejtekben, és az elnyomás nem tart tovább. Ennek a problémának a leküzdése érdekében az siRNS-t egy rövid hajtűszerkezet bevezetésével módosítják. Ez a módosított molekula, amelyet akkor shRNS-nek neveztek. Az shRNS-t egy Dicer-rel siRNS-vé kell átalakítani annak normális működésének folytatása érdekében.
Mi a különbség az shRNS és az siRNS között?
• Az siRNS-től eltérően az shRNS extra hajtűszerkezettel rendelkezik. Az shRNS az siRNS módosított változata.
• Az shRNS expressziós vektort igényel, míg az siRNS nem.
• Az shRNS hosszú távú leütésre, míg az siRNS csak rövid távú gének leütésére használható.
• Az siRNS génszuppressziójától eltérően az shRNS szuppressziója hosszan tartó, és ha megfelelő vírusvektoron keresztül inszertáljuk, állandó géncsendesítő hatást fejthet ki.
• Dicer-re van szükség ahhoz, hogy az shRNS visszaálljon siRNS-molekulává annak normális funkcióinak végrehajtása érdekében.
