A legfontosabb különbség az alloantitest és az autoantitest között az, hogy az alloantitest olyan antitest, amelyet alloantigének ellen termelnek, amelyek transzfúzió vagy terhesség által bevezetett idegen antigének. Eközben az autoantitest egy antitest, amely reagál az önantigénekkel.
Az antitestek immunválasz eredményeként keletkeznek. Ezek tükrözhetik az immunválasz jelenlétét, jellegét és intenzitását. Az immunrendszernek képesnek kell lennie az önantigének és az idegen antigének külön azonosítására. Funkciója szempontjából kritikus. Az immunrendszer B-sejtjei antitesteket termelnek antigének ellen. Az alloantitestek és az autoantitestek az ilyen antitestek két típusa. Az alloantitestek az alloantigének transzfúzióval vagy terhességgel történő szervezetbe juttatásának köszönhetően keletkeznek. Ezzel szemben az autoantitestek olyan antitestek, amelyek reagálnak az önantigénekkel. Az autoantitestek önantigénekkel való reakciója felelős a szövetek és szervek gyulladásáért, károsodásáért és működési zavaraiért, ami az autoimmun rendellenességek jeleihez és tünetekhez vezet.
