A legfontosabb különbség a DNS és az RNS nukleotid között az, hogy a DNS nukleotid vagy dezoxiribonukleotid dezoxiribóz cukrot, míg az RNS nukleotid vagy ribonukleotid ribóz cukrot tartalmaz.
A nukleotidok a nukleinsavak alapegysége. Ezek a DNS és az RNS építőkövei vagy monomerjei. Összekapcsolódva polinukleotidláncot képeznek, amely a DNS vagy RNS szerkezetét adja. A nukleotidban három fő összetevő van. Ezek nitrogén alapúak, pentóz cukor (öt szén cukor) és foszfát csoportok. Öt különböző nitrogénbázis létezik, mint például adenin, timin, citozin, guanin és Uracil. A timin csak a DNS-ben látható, míg az uracil egyedülálló az RNS-hez. A nukleinsavakban ötféle széncukor létezik. Az RNS ribózcukrot, míg a DNS dezoxiribózcukrot tartalmaz. A nukleotidok három foszfátcsoportot tartalmaznak, amelyek a pentózcukorhoz kapcsolódnak.