A legfontosabb különbség a DNS-RNS hibridek és a dsDNS között az, hogy a DNS-RNS hibridek kettős szálú nukleotidok, amelyek egy DNS-szálból és egy komplementer RNS-szálból állnak, míg a dsDNS kétszálú DNS, amely két komplementer DNS-szálból áll.
Natív állapotában a DNS kettős szálú. Két komplementer DNS-szála kapcsolódik hidrogénkötéseken keresztül. Az RNS natív szerkezetében egyszálú. Bizonyos esetekben az RNS duplexeket képez a DNS-sel. DNS-RNS hibridekként ismertek. Főleg az onkogén RNS vírusok transzkripciója és szaporodása során keletkeznek. A dsDNS-hez képest a DNS-RNS hibridek stabilabbak.
