A legfontosabb különbség a kodominancia és a több allél között az, hogy a kodominancia mindkét allél hatását önállóan fejezi ki, anélkül, hogy heterozigóta állapotban keveredne, míg a több allél egy olyan tulajdonság állapotára utal, amelynek kettőnél több allélja van.
Általában minden gén két különböző alléllel rendelkezik. Az egyik domináns allél, míg a másik recesszív allél. A mendeli örökség szerint a domináns allél kifejezi fenotípusát, miközben elnyomja a recesszív allélt heterozigóta állapotban. Egyes géneknek azonban három vagy több különböző allélja van egy tulajdonságra. Több allélnak hívják őket. A kodominancia ráadásul nem mendeli örökség. Ebben a jelenségben az utódok mindkét szülőgént mindkét gén kombinációjaként fogadják. Ezért mindkét gén egyformán expresszálódik az utódokban.
