A legfontosabb különbség az oligopeptid és a polipeptid között az, hogy az oligopeptidek kevés aminosavmaradékot tartalmaznak, míg a polipeptidek sok aminosavmaradékot tartalmaznak.
Az oligopeptidek és polipeptidek kifejezés a fehérjék kategóriájába tartozik. A peptidek rövid aminosavláncok. Az aminosavak peptidkötéseken keresztül kötődnek egymással. Ezért ezeket a peptideket az ezekben a peptidekben jelenlévő aminosavak száma alapján kategorizálhatjuk. Például dipeptidek, tripeptidek, tetrapeptidek, oligopeptidek és polipeptidek.