A legfontosabb különbség az ubikinonok és a citokrómok között az, hogy az ubikinonok (CoQ) nem fehérjék, míg a citokrómok fehérjék.
Az elektrontranszportlánc az aerob légzés utolsó szakasza. Ezért a mitokondrium belső membránjában fordul elő. Ezenkívül elektronhordozókból áll, amelyek megkönnyítik a protongradiens előállítását a membránon keresztül. A NAD és a flavoproteinek kivételével az ubikinonok és a citokróm kétféle elektronhordozó vesz részt az elektrontranszport láncban. Az ubikinonok nem fehérjében lipidben oldódó, hidrofób szerves molekulák, míg a citokrómok vasat tartalmazó fehérjék.
