A legfontosabb különbség a lentivírus és a retrovírus között az, hogy a lentivírus egyfajta retrovírus, míg a retrovírus egy RNS vírus, amely a reverz transzkriptáz enzimet tartalmazza, hogy az RNS genomot DNS-vé alakítsa, mielőtt a gazdaszervezetbe beillesztené.
Ezenkívül a retrovírusok a Retroviridae családba tartozó vírusok csoportja. Ebben a családban hét nemzetség létezik: Alpharetrovirus, Betaretrovirus, Gammaretrovirus, Deltaretrovirus, Epsilonretrovirus, Lentivirus és Spumavirus. Ezért a lentivírusok egyfajta retrovírusok.