A legfontosabb különbség az erjedés és a légzés között az, hogy az erjedés oxigén hiányában történik, miközben a légzéshez oxigénre van szükség.
A szervezeteknek energiára van szükségük a sejtes tevékenységek elvégzéséhez. Ennélfogva energiamolekulákat generálnak ATP formájában. Különböző szubsztrátumokat használnak, és különböző formákra bomlanak, és a felszabadító energia átalakul a sejtek által felhasználható energiamolekulákká. A glükóz számos szervezet elsődleges szubsztrátja. A fermentáció és a légzés két sejtszintű folyamat, amelyek energiát termelnek a glükóz lebontásával több lépésben. A légzés azonban hatékonyabb és több ATP-molekulát termel, mint a fermentáció.