A legfontosabb különbség a cisz- és transz-zsírsavak között az, hogy a cisz-zsírsavak két hidrogénatomhoz kapcsolódnak a kettős kötéshez a szénlánc ugyanazon oldalán, míg a transz-zsírsavakban a két hidrogénatom a kettős kötéshez kapcsolódik, ellentétben a szénlánc oldala.
A zsírsavak olyan karbonsavak, amelyek hosszú alifás szénláncokat tartalmaznak, amelyek telítettek vagy telítetlenek. Ez azt jelenti, hogy az alifás lánc tartalmazhat vagy nem tartalmazhat kettős kötést a szénatomok között. A cisz- és transz-zsírsavak a telítetlen zsírsavak két formája.
