A legfontosabb különbség a szubsztrát és az aktív hely között az, hogy a szubsztrát olyan kémiai vegyület, amely kémiai reakción megy keresztül, míg az aktív hely egy enzim specifikus régiója.
Az enzimek biológiai katalizátorok. Ezek olyan fehérjék, amelyek csökkenthetik egy kémiai reakció aktivációs energiáját annak érdekében, hogy csökkentsék a reakció energiagátját. Ennélfogva növelheti a reakció sebességét. Az enzimek által érintett reakció reagense a „szubsztrát”. Ez a szubsztrát kötődik az enzim aktív helyéhez. A reakciók ott zajlanak. Végül felszabadítja a reakció termékeit.
