A legfontosabb különbség a glioxiszómák és a peroxiszómák között az, hogy a glioxiszómák csak a növényi sejtekben és a fonalas gombákban vannak jelen, míg a peroxiszómák szinte az összes eukarióta sejtben vannak. A glioxiszómák a csírázó magvak növényi sejtjeiben, míg a máj- és a vesesejtekben a peroxiszómák.
Ez a két organella az eukarióta sejtekben jelen lévő mikrotest. A glioxiszómák olyan speciális peroxiszómák, amelyek csak növényi sejtekben és fonalas gombákban találhatók meg. A peroxiszómák olyan organellumok, amelyek elősegítik a hosszú zsírsavláncok lebontását és a sejt méregtelenítését. Lebontják az alkoholokat és más káros vegyületeket.