Főbb különbség - Baktériumok transzpozázai vs retrovírusos integrazák
A hordozható genetikai anyag két fő stratégiával fejlődött ki, hogy az egyik régióból a következő régióba költözzön belül és a genomok között. Az egyik módszer egy RNS-molekulán keresztül történő kiszorítás a DNS-molekula képződése előtt, míg a másik út DNS-intermediereket tartalmaz. A transzpozázok és a vírusos integrázok példák az ilyen transzponálható genetikai anyagra. A bakteriális transzpozázok kötődnek a transzpozonok végéhez, és különféle mechanizmusok révén megkönnyítik a transzpozon mozgásának katalizálását a genom másik részébe. A retrovírusos integrázok olyan enzimek, amelyek elősegítik a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának integrálódását az általa megfertőzött gazdasejt genetikai anyagába (DNS). Ez a legfontosabb különbség a baktériumok transzpozázai és a retrovírus integra között.
TARTALOM
1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbségek
2. Mik a baktériumok transzpozíciói
3. Mik a retrovírusos integrazák
4. A baktériumok transzpozázai és a retrovírusos integrazák közötti hasonlóság
5. Egymás melletti összehasonlítás - Bakteriális transzpozázok vs retrovírusos integrazák táblázatos formában
6. Összefoglalás
Mik azok a bakteriális transzpozázok?
A transzpozáz meghatározható a transzpozonok végéhez kötött enzimként, amely különböző mechanizmusok révén megkönnyíti a transzpozon mozgásának katalizálását a genom másik részébe. Ilyen mechanizmusok közé tartozik a „vágás és beillesztés” és a „replikatív átültetési mechanizmus”. A transzpozázt először a Tn3 transzpozon transzpozíciójához szükséges enzim klónozásával vezették be. Két fontos stratégiát alkalmaztak az átültethető genetikai elemek a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra történő elmozduláshoz. Az RNS közbenső részén keresztül történő transzport a DNS-másolat szintézise előtt az egyik stratégia, míg a másik csak a DNS-intermedierekhez kötődik. A mindkét elem integrációjában szerepet játszó rekombinációs reakciók az elemre jellemző enzimek miatt zajlanak le. És így,a DNS-elemek esetében ezeket az enzimeket transzpozázoknak, míg az RNS-elemeknek integrázoknak nevezik.
A transzpozíciós stratégiák közötti különbségek összehasonlításakor a beillesztés folyamata kémiailag azonosnak tűnik. A legújabb bizonyítékok azonban azt sugallják, hogy az integrációs mechanizmus bizonyos hasonlóságai észlelhetők az aktív helyet alkotó aminosav-szekvenciák régióiban; a DDE motívum. Öt transzpozáz családot osztályoznak jelenleg, de a családok száma még nem növekszik új transzpozáz karakterekkel. A családok magukban foglalják a DDE transzpozázt, a tirozin (Y) transzpozázt, a szerin (S) transzpozázt, a Rolling circle transzpozázt, a reverz transzkriptázokat / endonukleázokat (RT / En) stb. A DDE transzpozáz az eredeti transzpozon kivágási és beillesztési mechanizmusában vesz részt, és három konzervált aminosavat tartalmaz, nevezetesen;aszpartát (D), aszpartát (D) és glutamát (E). A tirozin transzpozázok a vágás és beillesztés mechanizmusban is szerepet játszanak a tirozin maradék felhasználásával, amely helyspecifikus.
01. ábra: Baktériumok transzpozázai
A szerin transzpozázok körkörös DNS köztitermékeket tartalmaznak, és a vágás és beillesztés mechanizmusát ugyanúgy hajtják végre, mint a fenti családok. A gördülő kör transzpozáz a másolási mechanizmusban vesz részt, ahol egyetlen szálat közvetlenül másolnak a célhelyre DNS replikáció útján. Ez biztosítja, hogy a sablonszálnak és a másolt szálnak legyen egy újonnan szintetizált szála. A reverz transzkriptázok / endonukleázok transzpozázának különböző mechanizmusai vannak a transzpozícióhoz.
Mik azok a retrovírusos integrák?
A Retrovirális Integráz összefüggésében retrovírus enzimnek tekintik, amely segíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) történő integrálódását. Ezeket a retrovírusos egészszámokat leggyakrabban összekeverik a fág-integrazákkal. A fág-integrázokra példák: λ-fág-integráz. De ezek teljesen különböző enzimek, és nem szabad összetéveszteni őket. A retrovirális preintegrációs komplex képződését illetően a retrovirális integráz játszik nagy szerepet. A retrovírus-integráz fehérjék jellemzően három (03) kanonikus doménből állnak. Ezeket a tartományokat rugalmas összekötők kapcsolják össze.
A három domén tartalmaz egy N terminális cinkkötő domént, ahol három spirális köteg kapcsolódik össze és stabilizálódik koordináció révén egy Zn 2+ részvételével.kation, egy RNáz H-szeres katalitikus magdomén és egy C-terminális DNS-kötő domén, amely egy SH3-szeres. Vizsgálattal, valamint biokémiai és strukturális információkkal arra utal, hogy a retrovirális integráz képes dimmerként (tetramer) működni. A multimerizáció és a vírus DNS-kötődésének összefüggésében a retrovirális integráz fehérje mindhárom doménje. A retrovirális integráz fő funkciója, hogy genetikai anyagát beilleszti a DNS gazdájába. Ez a lépés a legfontosabb lépés a HIV-vírus vírusreplikációjában. Miután sikeresen integrálódott, élete hátralévő részében ott lesz a sejt kromoszómális DNS-ében.
02. ábra: Retrovirális integrázok
Ezért az integráció után a cellának nincs visszatérése. Ezek a retrovírusos integrázok két fő reakció katalizálásával járnak, ideértve a 3'-végfeldolgozást és a kovalens ligálást. A 3'-végi feldolgozás során a vírus DNS mindkét 3'-végéből 2-3 nukleotidot távolítunk el azzal a céllal, hogy felfedjük a vírus DNS 3'-végének CA-dinukleotidjait, kovalens ligálás során pedig a feldolgozott 3'-végeket. a vírus DNS-t kovalensen ligáljuk a gazda kromoszóma DNS-be.
Milyen a hasonlóság a baktériumok transzpozázai és a retrovírusos integrazák között?
A bakteriális transzpozázok és a retrovírus-integrázok egyaránt hasonló aminosav-szekvenciákkal rendelkeznek
Mi a különbség a baktériumok transzpozázai és a retrovírusos integrazák között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Bakteriális transzpozázok vs retrovírusos integrázok |
|
| A bakteriális transzpozáz egy enzim, amely a transzpozonok végéhez kötődik, miközben különböző mechanizmusok révén megkönnyíti a transzpozon mozgásának katalizálását a genom másik részébe. | A retrovírus-integrázokat retrovírus-enzimnek tekintik, amely segíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának integrálódását a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS). |
| Kötelező régiók | |
| Magas specifikus kötési régiókra van szükség a baktériumok transzpozázaihoz. | Kevesebb, vagy egyáltalán nem szükséges nukleotidszekvencia a kötéshez. |
Összefoglalás - Bakteriális transzpozázok vs retrovírusos integrazák
A baktériumok transzpozázait retrovírus enzimnek tekintik, amely segíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának beilleszkedését a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS). Két fontos stratégiát alkalmaztak az átültethető genetikai elemek a genomok közötti vagy az egyik helyről a másikra történő elmozduláshoz. Öt transzpozáz családot osztályoznak jelenleg, de a családok száma még nem növekszik új transzpozáz karakterekkel. A retrovírus-integrázt retrovírus-enzimnek tekintik, amely segíti a retrovírus, például a HIV genetikai anyagának a fertőzött sejt genetikai anyagába (DNS) való integrálódását. A retrovírus-integráz fehérjék jellemzően három (03) kanonikus doménből állnak. A retrovirális integráz fő funkciója, hogy genetikai anyagát beilleszti a DNS gazdájába. Ez a lépés a legfontosabb lépés a HIV-vírus vírusreplikációjában. Ezért az integráció után a cellának nincs visszatérése. Ez a különbség a bakteriális transzpozázok és a Retroviral Integrase között.
Töltse le a Baktériumok transzpozázai vs retrovírusos integrációk PDF-fájlt
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra is használhatja, az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le a PDF-verziót itt: Különbség a baktériumok transzpozázai és a retrovírusos integrációk között
