A legfontosabb különbség a baktériumok és a puhatestűek között az, hogy a baktériumok általában peptidoglikán sejtfallal rendelkeznek, míg a puhatestűek egy olyan baktériumcsoportba tartoznak, amelyek nem rendelkeznek sejtfallal.
A baktériumok a leggyakoribb mikroorganizmusok, amelyek jelen vannak a természetben. Egysejtű szervezetek csoportja, amelyek mindenütt élnek. Továbbá prokarióta szervezetek. Ezért hiányzik belőlük a sejtmag és a membránhoz kötött organellák. Különböző baktériumcsoportok vannak. Néhányuk a cianobaktériumok nevű fotoszintetikus baktériumcsoportba tartozik. Általában a legtöbb baktérium merev sejtfallal rendelkezik. Néhány baktériumcsoport azonban nem rendelkezik ezzel a sejtfallal. A puhatestűek olyan baktériumok, amelyekből hiányzik a sejtfal. Ezért ez a cikk a baktériumok és a puhatestűek közötti különbséget tárgyalja.