Fő különbség - Proteomika vs Transcriptomics
Az omikus technológia a jelenlegi trend, amikor egy szervezet különböző biomolekuláira, mint tulajdonságokra és funkciókra mint egész gyűjteményre tekintünk. Az omikus technológiának sokféle alkalmazása van. A biológiai minta különféle omikája magában foglalja a genomikát, a proteomikát, a transzkripptikát és a metabolomikát. A proteomika magában foglalja egy élő szervezet összes fehérjéjének teljes vizsgálatát. Meghatározása az összes expresszált fehérje együttese egy szervezetben, annak szerkezeti és funkcionális tulajdonságai. A fehérjék teljes készlete tehát a proteomot alkotja. A transzkripptika az összes élő szervezetben jelen levő messenger RNS (mRNS) molekula teljes vizsgálata. A transzkripptika tehát az élő organizmusban aktívan expresszálódó génekkel foglalkozik. Az élő organizmusban található mRNS teljes készletét transzkriptómnak nevezzük. A proteomika és a transzkripptika közötti fő különbség a biomolekula típusán alapul. A proteomikában az élő organizmusban expresszált fehérjék teljes készletét tanulmányozzák, míg a transzkripptikában az élő organizmus teljes mRNS-ét.
TARTALOM
1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbség
2. Mi a proteomika
3. Mi a transzkripto-mika
4. A proteomika és a transzkripptika közötti hasonlóság
5. Egymás melletti összehasonlítás - Proteomika vs transzkriptomia táblázatos formában
6. Összefoglalás
Mi a proteomika?
A proteomika kifejezést 1995-ben hozták létre, és eredetileg egy sejtben, szövetben vagy egy organizmusban lévő teljes fehérjekomplementként definiálták. A proteomikai tanulmányok előrehaladásával ezután módosították, hogy olyan esernyőfogalomnak tekintsék, amelyben számos tanulmányi terület szerepel. Jelenleg a proteomika témakörben a fehérjék szerkezetét, orientációját, funkcióit, kölcsönhatásait, módosulásait, alkalmazhatóságát és fontosságát tanulmányozzák. Ezért jelenleg sok kutatás folyik a proteomika területén.
Az első proteomikai vizsgálatokat az Escherichia coli fehérjetartalmának azonosítására végezték. A teljes fehérjetartalom feltérképezése kétdimenziós (2D) gélek felhasználásával történt. Ennek sikere után a tudósok áttértek az olyan állatok teljes fehérjetartalmának jellemzésére, mint a tengerimalacok és az egerek. Jelenleg az emberi fehérje feltérképezése 2D gélelektroforézissel történik.
A proteomika alkalmazásai
A proteomika tanulmányozásának számos előnye van, mivel a fehérjék a fehérjék katalizátortulajdonsága miatt az aktivitás nagy részében szabályozó molekulák. Így a teljes fehérjék vizsgálata információt nyújthat a szervezet egészségi állapotáról. Néhány alkalmazás;
- Genom annotáció: Egy szervezet fehérjetartalmának tanulmányozásával meghatározható az aktív fehérje vegyületért felelős pontos genom. Ebben a szcenárióban az összes genomika eredménye, a transzkripptika és a proteomika fontos.
- Betegségek azonosítása / diagnosztika: A proteomikát használják a betegség állapotának azonosítására, az egészséges és a beteg összehasonlításával
- A kísérlet során vizsgált fehérje expresszió végrehajtása.
- Fehérjemodifikációk és interakciós vizsgálatok: A fehérjék in vitro és / vagy in vivo körülmények felhasználása, az extrahált fehérjék tárolási körülményeinek eldöntése, valamint a fehérje viselkedésének vizsgálata in vitro, in vivo és in-silico módszerekkel.
01. ábra: Proteomika
A proteomikában különböző technikák vannak
- A teljes fehérje kivonása és a fehérjék elválasztása 2D gélelektroforézissel. A fehérjék nagy teljesítményű folyadékkromatográfiával (HPLC) is elválaszthatók.
- A kivont fehérjék szekvenálása olyan módszerekkel, mint Edmund szekvenálási módszere vagy tömegspektrometria.
- A szekvenciák azonosítása után a fehérjetartalom strukturális és funkcionális tulajdonságait számítógépes szoftverek és bioinformatikai eszközök segítségével elemzik.
Mi az a Transcriptomics?
Az átirat kifejezést nemrégiben hozták létre. A Transcriptomics egy szervezet teljes mRNS-tartalmának vizsgálata. A teljes mRNS az élő szervezetben vagy egy sejtben expresszált DNS. Az mRNS teljes gyűjteményét transzkriptómnak nevezzük.
Az átirat elemzésének lépései a következők:
- RNS kivonása, az mRNS elválasztása oszlop gélkromatográfiával poli DT gyöngyökkel.
- Az mRNS szekvenálása megtörtént.
A mikroray technológia a szervezet transzkriptómjának azonosításának egyik általános módja. A mikroarray technika magában foglal egy próbalemezt, amely tartalmazza a transzkriptóm komplementer szálait. Hibridizáció után jellemezhető a szervezetben vagy sejtekben jelenlévő mRNS.
02. ábra: Transzkripptikus technikák
A transzkripptikát ma már széles körben használják az orvosi területen. A betegség diagnosztikája és a betegség profilozása azok a fő területek, amelyeken a Transcriptomics alkalmazható. Egy szervezet transzkriptómjának elemzésével idegen mRNS azonosítható, és ha vannak fertőzések, akkor azonosítható. A nem kódoló RNS transzkriptikus technológiákkal választható szét. A gének expressziója különféle környezeti terhelések mellett is nyomon követhető.
Milyen hasonlóságok vannak a proteomika és a transzkripptika között?
- Mindkettő az omikus technológia koncepciójának részét képezi.
- Mindkettőt a betegség diagnosztikájában és egy szervezet betegség jellemzésében használják.
- Mindkét vizsgálati terület magában foglalta a biomolekula kivonását, a biomolekula elválasztását és a szekvenálási lépéseket.
Mi a különbség a proteomika és a transzkriptomika között?
Különböző cikk a táblázat előtt
Protemics vs Transcriptomics |
|
| A proteomika magában foglalja egy élő szervezet összes fehérjéjének teljes vizsgálatát. | A transzkripptika az összes élő szervezetben jelen levő messenger RNS (mRNS) molekula teljes vizsgálata. |
| Tanult Bio Molecule Type | |
| A fehérjéket a proteomikában vizsgálják. | Az mRNS-t transzkripptikában vizsgálják. |
| Tanulmányozott tényezők | |
| A fehérjék szerkezetét, működését, kölcsönhatásait, módosulásait és alkalmazását a proteomikában vizsgálják. | A szekvencia felépítését, a környezettel való kölcsönhatásokat és az mRNS alkalmazását a transzkripptikában vizsgálják. |
Összegzés - Proteomika vs Transcriptomics
Az omics fontos szerepet játszik az élettudományok területén. A proteomika a proteom tanulmányozására utal, amely egy sejtben vagy egy organizmusban a fehérjék teljes gyűjteményét alkotja. A transzkripptika a transzkriptóm vizsgálatára vonatkozik, amely az expresszált DNS teljes halmaza, amely mRNS formájában van. A két vizsgálati terület, a proteomika és a transzkripptika, a genomika bevezetése után származik, és jelenleg széles körben használják az orvosi diagnosztikában, valamint az organizmusok jellemzésében és szűrésében. Ez a különbség a proteomika és a transzkripptika között.
Töltse le a Proteomics vs Transcriptomics PDF-fájlt
A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra is használhatja, az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le a PDF-verziót itt: Különbség a proteomika és a transzkriptomika között
