Különbség A Proteomika és A Transzkripptika Között

2024 Szerző: Mildred Bawerman | [email protected]. Utoljára módosítva: 2023-12-16 08:39

Fő különbség - Proteomika vs Transcriptomics

Az omikus technológia a jelenlegi trend, amikor egy szervezet különböző biomolekuláira, mint tulajdonságokra és funkciókra mint egész gyűjteményre tekintünk. Az omikus technológiának sokféle alkalmazása van. A biológiai minta különféle omikája magában foglalja a genomikát, a proteomikát, a transzkripptikát és a metabolomikát. A proteomika magában foglalja egy élő szervezet összes fehérjéjének teljes vizsgálatát. Meghatározása az összes expresszált fehérje együttese egy szervezetben, annak szerkezeti és funkcionális tulajdonságai. A fehérjék teljes készlete tehát a proteomot alkotja. A transzkripptika az összes élő szervezetben jelen levő messenger RNS (mRNS) molekula teljes vizsgálata. A transzkripptika tehát az élő organizmusban aktívan expresszálódó génekkel foglalkozik. Az élő organizmusban található mRNS teljes készletét transzkriptómnak nevezzük. A proteomika és a transzkripptika közötti fő különbség a biomolekula típusán alapul. A proteomikában az élő organizmusban expresszált fehérjék teljes készletét tanulmányozzák, míg a transzkripptikában az élő organizmus teljes mRNS-ét.

TARTALOM

1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbség

2. Mi a proteomika

3. Mi a transzkripto-mika

4. A proteomika és a transzkripptika közötti hasonlóság

5. Egymás melletti összehasonlítás - Proteomika vs transzkriptomia táblázatos formában

6. Összefoglalás

Mi a proteomika?

A proteomika kifejezést 1995-ben hozták létre, és eredetileg egy sejtben, szövetben vagy egy organizmusban lévő teljes fehérjekomplementként definiálták. A proteomikai tanulmányok előrehaladásával ezután módosították, hogy olyan esernyőfogalomnak tekintsék, amelyben számos tanulmányi terület szerepel. Jelenleg a proteomika témakörben a fehérjék szerkezetét, orientációját, funkcióit, kölcsönhatásait, módosulásait, alkalmazhatóságát és fontosságát tanulmányozzák. Ezért jelenleg sok kutatás folyik a proteomika területén.

Az első proteomikai vizsgálatokat az Escherichia coli fehérjetartalmának azonosítására végezték. A teljes fehérjetartalom feltérképezése kétdimenziós (2D) gélek felhasználásával történt. Ennek sikere után a tudósok áttértek az olyan állatok teljes fehérjetartalmának jellemzésére, mint a tengerimalacok és az egerek. Jelenleg az emberi fehérje feltérképezése 2D gélelektroforézissel történik.

A proteomika alkalmazásai

A proteomika tanulmányozásának számos előnye van, mivel a fehérjék a fehérjék katalizátortulajdonsága miatt az aktivitás nagy részében szabályozó molekulák. Így a teljes fehérjék vizsgálata információt nyújthat a szervezet egészségi állapotáról. Néhány alkalmazás;

1. Genom annotáció: Egy szervezet fehérjetartalmának tanulmányozásával meghatározható az aktív fehérje vegyületért felelős pontos genom. Ebben a szcenárióban az összes genomika eredménye, a transzkripptika és a proteomika fontos.
2. Betegségek azonosítása / diagnosztika: A proteomikát használják a betegség állapotának azonosítására, az egészséges és a beteg összehasonlításával
3. A kísérlet során vizsgált fehérje expresszió végrehajtása.
4. Fehérjemodifikációk és interakciós vizsgálatok: A fehérjék in vitro és / vagy in vivo körülmények felhasználása, az extrahált fehérjék tárolási körülményeinek eldöntése, valamint a fehérje viselkedésének vizsgálata in vitro, in vivo és in-silico módszerekkel.

01. ábra: Proteomika

A proteomikában különböző technikák vannak

1. A teljes fehérje kivonása és a fehérjék elválasztása 2D gélelektroforézissel. A fehérjék nagy teljesítményű folyadékkromatográfiával (HPLC) is elválaszthatók.
2. A kivont fehérjék szekvenálása olyan módszerekkel, mint Edmund szekvenálási módszere vagy tömegspektrometria.
3. A szekvenciák azonosítása után a fehérjetartalom strukturális és funkcionális tulajdonságait számítógépes szoftverek és bioinformatikai eszközök segítségével elemzik.

Mi az a Transcriptomics?

Az átirat kifejezést nemrégiben hozták létre. A Transcriptomics egy szervezet teljes mRNS-tartalmának vizsgálata. A teljes mRNS az élő szervezetben vagy egy sejtben expresszált DNS. Az mRNS teljes gyűjteményét transzkriptómnak nevezzük.

Az átirat elemzésének lépései a következők:

1. RNS kivonása, az mRNS elválasztása oszlop gélkromatográfiával poli DT gyöngyökkel.
2. Az mRNS szekvenálása megtörtént.

A mikroray technológia a szervezet transzkriptómjának azonosításának egyik általános módja. A mikroarray technika magában foglal egy próbalemezt, amely tartalmazza a transzkriptóm komplementer szálait. Hibridizáció után jellemezhető a szervezetben vagy sejtekben jelenlévő mRNS.

02. ábra: Transzkripptikus technikák

A transzkripptikát ma már széles körben használják az orvosi területen. A betegség diagnosztikája és a betegség profilozása azok a fő területek, amelyeken a Transcriptomics alkalmazható. Egy szervezet transzkriptómjának elemzésével idegen mRNS azonosítható, és ha vannak fertőzések, akkor azonosítható. A nem kódoló RNS transzkriptikus technológiákkal választható szét. A gének expressziója különféle környezeti terhelések mellett is nyomon követhető.

Milyen hasonlóságok vannak a proteomika és a transzkripptika között?

• Mindkettő az omikus technológia koncepciójának részét képezi.
• Mindkettőt a betegség diagnosztikájában és egy szervezet betegség jellemzésében használják.
• Mindkét vizsgálati terület magában foglalta a biomolekula kivonását, a biomolekula elválasztását és a szekvenálási lépéseket.

Mi a különbség a proteomika és a transzkriptomika között?

Különböző cikk a táblázat előtt

Protemics vs Transcriptomics
A proteomika magában foglalja egy élő szervezet összes fehérjéjének teljes vizsgálatát.	A transzkripptika az összes élő szervezetben jelen levő messenger RNS (mRNS) molekula teljes vizsgálata.
Tanult Bio Molecule Type
A fehérjéket a proteomikában vizsgálják.	Az mRNS-t transzkripptikában vizsgálják.
Tanulmányozott tényezők
A fehérjék szerkezetét, működését, kölcsönhatásait, módosulásait és alkalmazását a proteomikában vizsgálják.	A szekvencia felépítését, a környezettel való kölcsönhatásokat és az mRNS alkalmazását a transzkripptikában vizsgálják.

Összegzés - Proteomika vs Transcriptomics

Az omics fontos szerepet játszik az élettudományok területén. A proteomika a proteom tanulmányozására utal, amely egy sejtben vagy egy organizmusban a fehérjék teljes gyűjteményét alkotja. A transzkripptika a transzkriptóm vizsgálatára vonatkozik, amely az expresszált DNS teljes halmaza, amely mRNS formájában van. A két vizsgálati terület, a proteomika és a transzkripptika, a genomika bevezetése után származik, és jelenleg széles körben használják az orvosi diagnosztikában, valamint az organizmusok jellemzésében és szűrésében. Ez a különbség a proteomika és a transzkripptika között.

Töltse le a Proteomics vs Transcriptomics PDF-fájlt

A cikk PDF-verzióját letöltheti, és offline célokra is használhatja, az idézési megjegyzés szerint. Kérjük, töltse le a PDF-verziót itt: Különbség a proteomika és a transzkriptomika között