Különbség A Szonda és Az Alapozó Között

2024 Szerző: Mildred Bawerman | [email protected]. Utoljára módosítva: 2023-12-16 08:39

Fő különbség - Probe vs Primer

A molekuláris szonda egy kicsi DNS vagy RNS fragmens, amely felismeri a DNS vagy RNS komplementer szekvenciáit, és lehetővé teszi a célszekvencia azonosítását. Az alapozó a DNS vagy RNS kis szakasza, amely a DNS-szintézis kiindulópontjaként szolgál. A primerek és a próbák hibridizálódnak a templát DNS vagy a cél DNS komplementer nukleotidjaival. A legfontosabb különbség a próba és a primer között az, hogy a primerekre szükség van a DNS replikációjához, míg a próbákra a specifikus szekvenciák kimutatására van szükség a minta DNS-ben.

TARTALOM

1. Áttekintés és kulcsfontosságú különbségek

2. Mi a szonda

3. Mi az alapozó

4. Egymás mellett történő összehasonlítás - Szonda vs alapozó

5. Összefoglalás

Mi az a szonda?

A szonda a DNS vagy RNS kis töredéke, amelyet molekuláris hibridizációval detektálnak a mintában lévő cél DNS vagy RNS-re. Molekuláris markerként is ismertek. A próba hossza változhat (100-1000 bázis), és a próba nukleotidjai komplementerek a célszekvencia részével. A kimutatás megkönnyítése érdekében a próbákat radioaktív izotópokkal vagy fluoreszcens festékekkel vagy antitestekkel jelöljük. A próbák kötődnek a célszekvencia komplementer bázisaihoz, és felfedik a cél DNS vagy RNS jelenlétét a mintában. Két fő módszer létezik a szondák címkézésére: a végcímkézés és a nick fordítása. A próbákat különböző típusokba sorolják, ideértve a DNS-próbákat, az RNS-próbákat, a cDNa-próbákat és a szintetikus oligonukleotid-próbákat, és különféle technikák alkalmazásával állítják elő őket.

A szondák fontos eszközök számos mikrobiális és molekuláris területen, mint például a virológia, a törvényszéki patológia, az apasági tesztek, a DNS-ujjlenyomatok, a genetikai betegségek felderítése, RFLP, molekuláris citogenetika, in situ hibridizáció stb.

01. ábra: Fluoreszcensen jelölt próba, amelyet a FISH-ben használtak kórokozók kimutatására

Mi az alapozó?

Az alapozó egy rövid DNS- vagy RNS-fragmens, amely a DNS-szintézis iniciátoraként szolgál. A DNS-polimeráz enzim nukleotidokat ad hozzá a primer szekvencia 3 'OH csoportjához, és szintetizálja az új szálat, amely komplementer a templát DNS-sel. A primerek nagyon rövid, 18-20 nukleotid hosszúságú fragmensek. A laboratóriumban kémiailag szintetizálják őket in vitro DNS-amplifikáció (PCR) céljából. A primereknek bármilyen nukleotidszekvenciája lehet, mivel azokat a felhasználó tervezi. Úgy szintetizálják, hogy illeszkedjenek a templát DNS komplementer bázisaihoz. Ezért bármilyen nukleotidszekvenciája lehet. A primerek rendkívül fontosak a DNS-replikáció szempontjából, mivel a DNS-polimeráz nem képes szintetizálni az új DNS-t egy már létező DNS-darab nélkül. A PCR-alapozók megtervezésekor a következőket kell figyelembe venni:

• A primereknek tartalmazniuk kell a komplex nukleotidokat az amplifikálni kívánt DNS szélső végéhez.
• Az alapozók olvadáspontjának 55-65 ⁰ C között kell lennie
• A G- és C-tartalomnak 50-60% között kell lennie.

Két primert használunk PCR-ben előre és hátra a minta DNS mindkét szálának replikálásához. A primereket általában PCR és DNS szekvenálás elvégzésére használják.

02. ábra: Alapozó izzítás PCR-ben

Mi a különbség a Probe és az Primer között?

Különböző cikk a táblázat előtt

Probe vs Primer
A szonda a DNS / RNS kis töredéke, amelyet molekuláris hibridizációval detektálnak a mintában a célszekvencia jelenlétére.	A primer egy kis DNS- vagy RNS-szakasz, amely kiindulópontként szolgál a DNS-replikációhoz.
Funkció
Ez kimutatja egy adott szekvencia jelenlétét a DNS vagy RNS mintájában.	Ez a DNS-szintézis kiindulópontjaként szolgál.
Hossz
A hossza 100 és 1000 bázis között lehet	A hossz általában 18-20 alap
Kötés kiegészítő sorrenddel
A szonda hibridizál a célszekvencia komplementer bázisaival	A primer a DNS-szálak komplementer bázisaival hoz létre.
Címkézés
A szondákat az észlelés megkönnyítése érdekében címkével látták el	Az alapozók általában nincsenek felcímkézve
Használja PCR-ben
A szondákat nem alkalmazzák a PCR-ben	A primereket a PCR-ben használják

Összegzés - Probe vs Primer

A szonda a DNS vagy RNS szekvencia kis töredéke, amelyet komplementer nukleotidokkal hibridizálhatunk a célszekvencia kimutatására a mintában. A próbákat radioaktívan, immunológiailag vagy fluoreszcensen jelölik, hogy lássák a célszekvencia jelenlétét. A primer egy nagyon kicsi DNS- vagy RNS-fragmens, amely az in vitro DNS-amplifikáció kiindulópontjaként szolgál. A DNS-polimeráz azonosítja a 3 'OH-csoport láncindítót, és elindítja a templáttal komplementer új szál felépítését. A próbák és a primerek hasonlóan működnek, ha komplementer nukleotidokkal hibridizálnak. Így a próba és az alapozó közötti fő különbség az elsődleges funkciójuk.