A fő különbség a szonda szonikátor és a fürdő szonikátor között az, hogy a szonda szonikálásakor a szonda közvetlen kapcsolatban áll a mintával, míg a fürdő szonikátor izolálja a mintát az energiaforrástól.
A szonikálás olyan sejtmegszakítási módszer, amely hangenergiát vagy nagyfrekvenciás hanghullámokat használ fel a sejtek megtörésére. Ez egy fizikai sejtbontási technika, amely rendkívül hatékony a baktériumok, élesztők, gombák, algák és emlős sejtek megzavarásában. Nagyfrekvenciás hanghullámok alkalmazása esetén sok hőt termel. Ezért hűvös körülmények között ultrahangkezelést kell végezni, különösen a mintát jégfürdőbe merítve.
A szonikálás a legalkalmasabb a 100 ml alatti térfogatú mintákhoz. A többi módszerrel összehasonlítva az ultrahanggal végzett sejtlízis gyorsan és egyszerűen kezelhető. A szonikátor az ultrahangos kezeléshez használt berendezés. A szonda szonikátor és a fürdő szonikátor kétféle berendezés, amelyet ultrahanggal kezelnek. A szonda vagy a fürdő szonikátor hangenergiát biztosít a hallható tartományban.