A legfontosabb különbség a biomining és a bioleaching között az, hogy a biomining módszer a prokarióták vagy gombák felhasználása az ásványi anyagok fémek kinyerésére, míg a bioleaching a baktériumok felhasználása az ásványok fémjeinek kinyerésére.
Számos különböző módszer alkalmazható fémek kinyerésére ércükből vagy ásványi hulladékaikból. Ezen technikák többségében kémiai reagenseket használnak az extrakcióhoz. Ezért a káros melléktermékek és a környezetre gyakorolt káros hatások gyakori kérdés ebben a technikában. A biológiai bányászat és a bioleaching olyan technikák, amelyekkel élő szervezetek segítségével fémeket nyernek ki ércükből.
