A legfontosabb különbség az orbitális diagram és az elektronkonfiguráció között az, hogy a pálya diagram az elektronokat nyilakban mutatja, jelezve az elektronok spinjét. De az elektronkonfiguráció nem mutat részleteket az elektronok spinjéről.
Az orbitális diagram az elektronkonfiguráció által megadott elektronok elrendezését mutatja. Az elektronkonfiguráció részletesen ismerteti az elektronok eloszlását az atom pályáin. De a pálya diagram az elektronok forgását is mutatja. Ez az alapvető különbség az orbitális diagram és az elektronkonfiguráció között.