A legfontosabb különbség az RQ és az RER között az, hogy az RQ egy közvetlen mérés a vérből és az RER a légzésen keresztül végzett közvetett mérésből.
A kalorimetria az anyagcseréből vagy az energiafelhasználásból felszabaduló hőmennyiséget méri. Az anyagcseréhez oxigénre van szükség, és ez szén-dioxidot termel. A légzési hányados (RQ) és a légzéscsere arány (RER) két hasonló kalorimetriás mérés. Az RQ azonban a vérből vett közvetlen mérés. A gáz arányának metabolikus cseréje egyenlő a CO 2 termeléssel az oxigénfelvétel felett (CO 2 / O 2). A RER egy közvetett mérés, amelyet a légzéssel mérnek. Ezért az RQ invazív módszer, míg az RER nem invazív módszer.