A viroid és a virusoid közötti legfontosabb különbség az, hogy a viroid egy kicsi fertőző ágens, amely csak egyszálú RNS-ből áll, míg a virusoid egyfajta fertőző körkörös egyszálú RNS, amelynek segítő vírusra van szüksége a sejt megfertőzéséhez.
A viroid és a virusoid kétféle fertőző részecske, amelyek egyszálú RNS-ből állnak. Különböznek a vírusoktól, mivel nem rendelkeznek fehérjebevonattal. A vírusokhoz hasonlóan azonban nem képesek önmagukat replikálni. Ezért szükségük van gazdasejtre a szaporodáshoz. Sőt, a viroidok és a virusoidok a legkisebb szubvírus replikonok.
