A müonok és a mezonok közötti legfontosabb különbség az, hogy a müonok egyfajta elemi részecskék, amelyeknek nincs alépítményük, míg a mezonok egyfajta hadronikus szubatomi részecskék, amelyeknek van egy pár kvark- és anti-kvark részecskéje.
A müonok és a mezonok az anyag kétféle részecskéje. A müonok egyfajta elemi részecskék, például elektronok, és nem oszthatjuk őket tovább kisebb szerkezetekre (például kvarkokra). De a mezonok valamivel nagyobbak, mint a müonok, és kvark- és antikvarkszemcséket tartalmaznak; így egy másik kategóriába tartoznak, az úgynevezett hadrikus szubatomi részecskéknek. A hadronikus kifejezés kifejezés azt jelzi, hogy két vagy több kvarkrészecskét tartalmaz, és a szubatomi részecskék az atomoknál kisebb szerkezetek, amelyek felépítik az atom szerkezetét.
