A legfontosabb különbség a pepszin és a renin között az, hogy a pepszin, amely az egyik fő emésztőrendszeri enzim, a gyomor által kiválasztott proteáz, míg a renin enzim és a vese juxtaglomeruláris sejtjei által termelt hormon is.
A proteázok olyan enzimek, amelyek hidrolizálják a peptidkötéseket és lebontják a fehérjéket peptidekké vagy aminosavakká. A pepszin a gyomornedvben található proteáz. Ez az egyik fő emésztőrendszer, amely fehérjés ételeket peptidekké és aminosavakká bont. Ezzel szemben a renin enzim és aszparaginsav proteáz. Ez a renin-angiotenzin rendszer kezdeményező enzime. A renin hormonként működik, és segít a vérnyomás szabályozásában.