Az alapító hatás és a genetikai sodródás közötti legfontosabb különbség az, hogy az alapító hatás egy olyan genetikai sodródás eseménye, amelyben egy kis csoport elszakad a fő populációtól, hogy telepet hozzon létre, míg a genetikai sodródás az allél frekvenciák véletlenszerű változásaira utal a kis populációkban, amelyek bizonyos gének eltűnése az idő múlásával.
Az evolúció az a folyamat, amely megmagyarázza az organizmusok tulajdonságainak változását az egymást követő generációk során. Az evolúció a természetes szelekción és a genetikai sodródáson alapszik. A természetes szelekció következtében a populációkban továbbra is kedvező tulajdonságok maradnak, míg a kedvezőtlen tulajdonságok idővel csökkennek a populációkhoz képest. Hasonlóképpen, a genetikai sodródás véletlenszerű változásokat okoz az allélfrekvenciákban kis populációkban, annak következtében, hogy egyes gének elhalnak vagy elkerülik a szaporodást. Az alapító hatás és a szűk keresztmetszet a genetikai sodródás két eseménye.
