Az anyai és az apai DNS-teszt közötti legfontosabb különbség a vizsgálati eljárás során használt DNS-forrás típusán alapszik. Az anya DNS-tesztje mitokondriális DNS-t használ az anyai származás megszerzéséhez, míg az apai DNS-teszt Y-DNS-t használ az apai származás megszerzéséhez.
Az ősök meghatározása mind a hímeknél, mind a nőknél fontos a családi kapcsolatok meghatározása érdekében. Sőt, az anyai és apai DNS-tesztek meghatározzák az egyének identitását is. Az ebben az elemzésben alkalmazott molekuláris technikák közül néhány a DNS-ujjlenyomatvétel, a rövid tandem ismétlések elemzése és a restrikciós fragmens hosszának polimorfizmusa (RFLP).
