Az alfa és a béta spirál közötti fő különbség a hidrogénkötés típusától függ, amelyet ezeknek a szerkezeteknek a kialakításakor képeznek. Az alfa hélixek molekulán belüli hidrogénkötéseket, míg a béta hélixek molekulák közötti hidrogénkötéseket alkotnak.
A komplex fehérjéknek négy szerkezeti szervezeti szintjük van - elsődleges, másodlagos, tercier és kvaterner. A fehérjék szekunder szerkezete különböző orientációban képezi a peptidláncokat. A peptidláncok peptidkötésekkel kötött aminosavszekvenciákból állnak. Ezért a fehérjékben két fő másodlagos szerkezet van, mint alfa-spirál és béta-spirál. Ezen kívül vannak más másodlagos struktúrák is, amelyeket béta fordulatnak és hajtűknek neveznek. Ez a cikk elsősorban az alfa és a béta spirál közötti különbségre összpontosít.
