A legfontosabb különbség az alfa- és a béta-anomerek között az, hogy az alfa-anomerben az anomer szénatomon lévő hidroxilcsoport cisz az anomer központban lévő exociklusos oxigénnel szemben, míg a béta anomer esetében a hidroxil csoport az exociklusos oxigéné transz.
Az anomer a szénhidrátok geometriai változata. Ez egy olyan típusú epimer, amelyben egy anomer szénatomot láthatunk. Az anomer szénatom a szénhidrát nyitott láncú szerkezetének karbonil-szénatomjából származik. Ezért a ciklikus szerkezet kialakulását a nyílt láncú szerkezetből anomerizációnak nevezzük.
