A legfontosabb különbség a genomi és a plazmid DNS között az, hogy a genomi DNS elengedhetetlen a szervezetek, köztük a baktériumok túléléséhez, míg a plazmid DNS nem elengedhetetlen a baktériumok túléléséhez.
Minden élő szervezetnek van genetikai anyaga, amely ellenőrzi általános működését. A genetikai anyag főleg kromoszómális DNS-ként létezik. Az eukariótákban a genomiális DNS a sejtmagban, míg a prokariótákban a genomiális DNS a citoplazmában van jelen. A kromoszómális DNS-n vagy a genomi DNS-n kívül néhány organizmusnak, köztük a baktériumoknak, az archeáknak és az élesztőnek van extra-kromoszómális DNS-je, amelyet plazmid DNS-nek neveznek. A plazmid DNS nem elengedhetetlen ezen szervezetek mindennapi működéséhez. Ezek azonban további előnyöket nyújtanak ezeknek az organizmusoknak, mivel számos fontos gént tartalmaz. Fontos megjegyezni azt is, hogy ezek a gének nem annyira létfontosságúak, mint a genomi DNS-ben található gének. Tehát, ez a cikk megkísérli megvitatni a genomi és a plazmid DNS közötti különbséget.