A legfontosabb különbség az F plazmid és az R plazmid között az, hogy az F plazmid extrakromoszómális DNS, amely termékenységi faktort kódoló géneket tartalmaz. Eközben az R plazmid egy extrakromoszómális DNS, amely az antibiotikumokkal szembeni rezisztenciát kódoló géneket tartalmaz.
A plazmid egy kis, kör alakú kettős szálú DNS, amely a baktériumokban található. Ezek extrakromoszómális DNS-ek, és képesek önreplikációra. Az önreplikációjukhoz és fenntartásukhoz szükséges géneket hordozzák magukban. Az önreplikációhoz szükséges géneken kívül a plazmidok számos egyéb szükséges gént is tartalmaznak a különleges tulajdonságok kódolásához, mint például az antibiotikumokkal szembeni rezisztencia, a makromolekulák lebomlása, a nehézfémek toleranciája, a bakteriocinek termelése, a gének transzferje stb. hasznos a baktériumok számára.
Ezenkívül nagyon sokféle plazmid létezik. Az R plazmidok és az F plazmidok kétféle típusúak. Az F plazmid egy termékenységi plazmid, amely képes konjugálódni és nemi pilieket termelni. Az R plazmid egy rezisztencia plazmid, amely képes rezisztenciát biztosítani az antibiotikumokkal és bizonyos baktériumnövekedés gátlókkal szemben.