A legfontosabb különbség az eukarióta és a prokarióta organizmusok között az, hogy az eukarióta organizmusok valódi maggal és membránhoz kötött organellákkal rendelkeznek, míg a prokarióta organizmusokból hiányzik a mag és a membránhoz kötött organellumok.
Minden élő szervezet két kategóriába tartozik, nevezetesen a prokarióták vagy az eukarióták. A prokarióta organizmusok egyszerű sejtszervezetet mutatnak, míg az eukarióta organizmusok összetett sejtszervezetet mutatnak. Sőt, a prokarióták egysejtűek, és hiányzik belőlük a mag és a membránhoz kötött organellák. Másrészről, az eukarióták általában többsejtűek, és valódi magot és membránhoz kötött organellákat tartalmaznak, például kloroplasztokat, mitokondriumokat és endoplazmatikus retikulumokat stb. A fent említett különbségektől eltekintve több különbség van a prokarióták és az eukarióták között. Ezért nagyon fontos megérteni a prokarióta és az eukarióta organizmusok közötti különbségeket. A cikk célja az eukarióta és a prokarióta organizmusok közötti különbség megvitatása.
