A legfontosabb különbség a prosztaglandin E1 és az E2 között az, hogy a prosztaglandin E1 (PGE1) gyulladáscsökkentő tényező, míg a prosztaglandin E2 (PGE2) gyulladáscsökkentő tényező.
A prosztaglandinok lipid eredetű vegyületek, amelyek hormonszerű funkcióval rendelkeznek. Autokrin vagy parakrin vegyületekként működhetnek, antagonista vagy szinergetikus hatást fejtenek ki az élő organizmusokban. A prosztaglandin E1 és a prosztaglandin E2 kétféle, és különböznek a gyulladás funkcionalitásától. Az E1 és az E2 prosztaglandin ugyanabba a prosztaglandin E2 családba tartozik, reakcióalapjuk és hatásuk még nem tisztázott teljesen. Élőlények különféle biokémiai mechanizmusainak kezelésében használják őket.