A kaperonok és a kaperoninok közötti fő különbség az, hogy a kaperonok sokféle funkciót látnak el, ideértve a fehérje hajtogatását és lebontását, a fehérje összeállítását, stb., Míg a kaperoninok fő feladata a nagy fehérjemolekulák hajtogatásának segítése.
A molekuláris chaperonok vagy chaperonok olyan fehérjemolekulák, amelyek elősegítik a fehérjék összetett struktúrákba való hajtogatását. Ezért a kaperoninok egyfajta chaperonok, amelyek hősokk-fehérjéket tartalmaznak. Az összes típusú chaperon közül a kaperoninok a legszélesebb körben tanulmányozott fehérjék, mivel fontos szerepet játszik a megfelelő fehérje hajtogatás során. Ezért a chaperonok és chaperoninok hatása megakadályozza a fehérjék visszafordíthatatlan aggregálódását és ezáltal lehetővé teszi azok működését. A kaperonok és a kaperoninok percenként különböznek a két molekula funkcionalitása alapján.